Несмотря на то, что оба слова происходят от глагола «гнить», их значение в современном языке абсолютно разное.
Правильно
Гниль — что-либо гнилое, испорченное, повреждённое гниением. Данное существительное употребляется по отношению к любому объекту, который может быть гнилым (материалы, растения, абстрактные понятия).
Почти на всех яблоках уже проступила гниль.
Из-за неправильного хранения на древесине образовалась гниль.
После этого я понял, как гниль таится в его душе.
Гной — медицинский термин, который означает продукт гниения ткани живого организма. Наиболее часто употребляется в медицинской лексике.
С помощью данной процедуры мы удалим гной.
Гной мешает заживлению раны.
При неправильной обработке раны может образоваться гной.