Правильно
Колышется — проверка написания гласной в данном глаголе сводится к классическому правилу спряжения глаголов. Поскольку инфинитив слова заканчивается на «-ать» (колыхать, колыхаться), то глагол относится к первому типу спряжения. По правилам такие глаголы в безударных личных окончаниях пишутся через «е» — колышется.
От лёгкого ветра штора едва колышется.
В поле волнами колышется пшеница.
Тишина такая, что даже вода в реке не колышется.
Только лодка едва колышется у причала.
Неправильно
Колишится.