Правильно
Не полностью – единственно правильный вариант написания этого наречия в русском языке. Согласно правилам русского языка наречия с «не» пишутся раздельно, если они не оканчиваются на «о». «Не полностью» заканчивается на «ю», поэтому пишем раздельно.
Тема курсовой работы раскрыта не полностью.
Через не полностью закрытую дверь Сережа видел как мама готовила обед.
Мы не можем переехать в новый дом, так как там не полностью закончен ремонт.
Мужчина отвернулся, так как девушка была одета не полностью.
Неправильно
Неполностью, ниполностью.