Эти слова являются синонимами, но имеют небольшое отличие в контексте.
Правильно
Отбраковать — глагол означает сортируя, отобрать (негодное), отсортировать, отделить при сортировке признав браком. Данное действие может быть совершено человеком или каким-либо устройством.
Сортировочный аппарат может отбраковать изделия прямо на линии.
Ему пришлось отбраковать почти половину партии.
Отбраковать нужно только абсолютно неисправные изделия.
Забраковать — означает расценить как брак; признать негодным, не соответствующим каким-либо требованиям. Данный глагол обычно употребляется только по отношению к человеку.
Жюри забраковали мою работу.
Механик забраковал данную запчасть.
Мою работу забраковали и не стали даже проверять.