Правильно
Семечко — словари русского языка однозначно определяют форму существительного в единственном числе — семечко. Это слово среднего рода, уменьшительно-ласкательное производное от существительного «семя».
Я посадил в землю арбузное семечко
Не нужно есть яблочное семечко
Это семечко неизвестного фрукта
Я нашел на полу семечко тыквы
Одно семечко яблока не вырастет
Семечка — при таком написании это существительное «семечко» в родительном падеже единственного числа.
В этой коробке нет семечка, которое ты просил найти
Странно, но в тыкве нет ни одного семечка
В вазоне нет семечка этого цветка
Неправильно
Одна семечка, семечка яблока, семечка подсолнуха