Правильно
Недочёт — единственно правильное написание существительного, которое зафиксировано в словарях русского языка. После «ч» всегда пишется буква «ё», поскольку корень слова «чёт».
При пересчете остатков мы выявили недочеты.
Все недочеты были немедленно устранены.
Этот недочет мы постараемся исправить.
В кассе был обнаружен недочет.
Неправильно
Недочот, не дочёт.